Пропал без вести в феврале 1942 г. в боях за Ленинград.
Поисковый отряд «Ингрия» обнаружил останки бойца В. А. Аполлонова в «Роще Круглой» Кировского района Ленинградской области 26.04.2010 г. При погибшем обнаружен медальон, в котором записано: «Аполлонов Василий Александрович, 1903 г. р., Вологодская обл., район Кубенский на озере, с/с Вепревский.
Данные электронной Книги Памяти Вологодской области: Аполлонов Василий Александрович, 1902 г. р., Вологодская обл., Вологодский район, Кубенский с/с, село Кубенское.